非标记蛋白质组通常指的是在蛋白质组学研究中，不依赖于任何形式的化学或同位素标记来进行蛋白质定量分析的一组蛋白质。它们的分析和定量依赖于不涉及化学标记的技术手段，如基于质谱的相对定量分析。
非标记蛋白组的意义
技术简便性：非标记蛋白组学方法由于省略了复杂的标记步骤，操作更为简便，降低了实验的复杂性和成本。
数据的自然状态：由于没有化学标记的干扰，非标记蛋白组分析能更自然地反映蛋白质在生物样品中的真实状态。
适用性广泛：对于无法进行化学标记的样品或者标记方法可能引入偏差的情况，非标记蛋白组提供了一种有效的分析选择。
图1. Label Free定量蛋白组学
在蛋白质组学研究中，非标记方法特别适用于那些样品数量有限或者样品类型多样性较大的研究。例如，在疾病生物标志物的发现、细胞响应机制的研究或者组织特异性蛋白质表达的分析中，非标记蛋白组学方法常常被选用。
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